История кафедры вычислительной техники начинается c середины 80-х годов со становления вычислительного центра Оренбургского политехнического института и кафедры «Вычислительная техника и прикладная математика» (ВТиПМ).
В 1993 году в Оренбургском государственном университете был организован факультет электроники и вычислительной техники, в состав которого вошла кафедра ВТиПМ. В этом же году в связи с открытием двух специальностей: «Программное обеспечение вычислительной техники и автоматизированных систем» (ПОВТАС) и «Вычислительные машины, комплексы, системы и сети» (ВМКСС) кафедра ВТиПМ разделилась на две кафедры: ПОВТАС и ВМКСС.
В январе 2004 года на базе кафедры открыта локальная сетевая академия Cisco по программам дополнительного профессионального образования Учебного центра Cisco Systems.
Первым заведующим кафедрой ВМКСС был доцент, канд. техн. наук Павел Николаевич Ганский, перешедший позже в Региональный центр информации главного управления Центрального банка РФ по Оренбургской области. Кафедрой также руководили: И.В. Матвейкин, Е.А. Корнев, В.Н. Тарасов. С 2006 года по октябрь 2023 года заведующим кафедрой был доктор технических наук, профессор Аралбаев Ташбулат Захарович. С ноября 2023 года заведующим кафедрой является доктор технических наук, доцент Тугов Виталий Валерьевич.
Первый выпуск инженеров в количестве 39 человек состоялся в 1998 году.
В разное время на кафедре работали ведущие специалисты в области вычислительной техники и информационных технологий. К ним относятся профессора: В.Д. Шевеленко, В.Н. Булатов, В.И. Чепасов, Т.М. Зубкова, доценты: В.Б. Шашков, Ю.А. Кудинов, В.А. Красильникова, А.Т. Раимова, Г.Г. Аралбаева, В.И. Кутузов, Ю.И. Синицын, Е.В. Бурькова, Т.Н. Шалкина, А.С. Боровский, Р.И. Хасанов, А.В. Каменев, А.Т. Юсуфов. Некоторые из них успешно работают по настоящее время.
За время существования кафедрой подготовлены и выпущены более 1 000 специалистов для предприятий и организаций Оренбургской области. Среди выпускников кафедры: директор Тюменского департамента ИТ ООО ТБ «Информ» А.В. Шалкин, начальник управления связи ОАО «Оренбурггазпром» А.К. Миронов, начальник отдела управления обслуживания ООО ТБ «Информ» А.Е. Заварихин, начальник отдела центра обработки данных ООО ТБ «Информ» Г.Ф. Дрючатый, ведущий программист Оренбургского отделения Федерального казначейства Я.И. Омелай, доцент кафедры «ИиВТ» Тюменского нефтегазового университета Т.Н. Шалкина, заместитель директора ЦИТ по программным системам П.В. Веденеев, заведующий сектором электронного обучения ЦИТ ОГУ А.А. Рычкова, начальник отдела АСУ ООО «Газпромтранс» Ю.В. Пузин и другие руководители ведущих предприятий Оренбуржья.
С 2008 года кафедра начала подготовку выпускников по новой специальности «Комплексная защита объектов информатизации».
26 июня 2013 года кафедра была переименована на кафедру вычислительной техники и защиты информации.
Кафедра обеспечивает подготовку бакалавров по направлениям подготовки: «Информационная безопасность» и «Информатика и вычислительная техника». Подготовка бакалавров ведется по профилям: «Безопасность автоматизированных систем (информационные технологии и электронная промышленность)» и «Вычислительные машины, комплексы, системы и сети».
Лаборатории кафедры оснащены современными сетевыми стендами, мультимедийным оборудованием, учебными аппаратно-программными средствами защиты информации. Сотрудниками кафедры совместно со студентами разработаны действующие стенды для организации специальных лабораторий. В учебном процессе используются электронные учебные пособия преподавателей кафедры.
Выпускники и сотрудники кафедры успешно сочетают учебную деятельность с научной работой, ими защищены 2 докторские диссертации: В.Н. Тарасовым и Т.З. Аралбаевым, а также 12 кандидатских диссертаций: Т.Н. Шалкиной, Е.В. Бурьковой, Е.И. Ананьевой, А.С. Саюшкиным, А.Ю. Кручининым, А.Е. Заварихиным, А.Л. Конновым, А.А. Рычковой, А.Г. Африным, Р.Р. Галимовым, Р.И. Хасановым и А.И. Сарайкиным.
В настоящее время под руководством профессора Т.З. Аралбаева на кафедре проводятся научные исследования по направлению «Разработка имитационных моделей, методов и средств мониторинга состояния защищенности распределенных информационно-вычислительных систем и мобильных объектов информатизации».
Научно-методические труды кафедры ВТиЗИ опубликованы в монографиях, в центральных российских журналах, в зарубежных изданиях, на страницах Интернет, а также защищены авторскими свидетельствами на программные средства и патентами на изобретения.
Кафедра поддерживает научные связи с ведущими вузами страны: Воронежским государственным техническим университетом, Магнитогорским государственным техническим университетом имени Носова, Московским государственным университетом имени Баумана, Санкт-Петербургским государственным университетом информационных технологий, механики и оптики, Самарским государственным аэрокосмическим университетом, Поволжской государственной академией телекоммуникаций и информатики, Уфимским университетом науки и технологий.
В настоящее время коллектив кафедры включает 2 доктора технических наук, 9 кандидатов технических, экономических и педагогических наук., 3 преподавателей и ассистента. Зав. кафедрой д.т.н., доцент, Тугов Виталий Валерьевич.